福建正式设立涉台检验检疫标准法规研究中心
2009年海峡两岸合作首个实验区——福州（平潭）综合实验区建设也正式启动。福建检验检疫局积极行动起来，第一时间出台10项措施，在贸易、旅游、物流等方面推出优惠政策，开辟绿色通道，实施直通放行，简化流程和检验项目，提供高效便捷服务，促进福州(平潭)综合实验区的开放开发。同时，成立实验区工作联络办公室，与其管委会加强协作，创新合作方式，建立信息共享机制和定期例会制度。
同时，福建检验检疫局正式设立涉台检验检疫标准法规研究中心。在中国WTO/TBT-SPS国家通报咨询中心的指导下，开展涉台检验检疫标准法规信息收集、分析、发布、咨询、培训等工作。目前，拥有30多种涉台检验检疫杂志、报刊、图书等资料，开通了《台湾标准全文数据库》，内容涵盖26个行业、16000多条台湾标准和法规信息，可以满足相关部门涉台检验检疫工作的日常需求。
2009年2月，台湾海基会董事长江丙坤在会见以福建省副省长叶双瑜为团长的福建经贸交流考察团时表示，福建在两岸经贸交流与合作方面应该先行先试，比如在通关方面，可试行一方检验另一方认可。此建议一经提出，立即得到福建检验检疫局的高度关注。鉴于台湾方面对两岸检验检疫结果互认存有共识。在福州黄岐口岸，福建局对台湾有关方面出具的甲鱼受精卵《输出动物产品检疫证明书》、茶叶《输出植物检疫证明书》等予以接受和认可；对台湾渔船自捕水产品输闽的，参照大陆远洋自捕渔船的做法，凭公海自捕鱼许可证接受报检，受到台胞的欢迎。
签署海峡两岸首份涉台检验检疫工作合作备忘录。在2009年9月7日由福建省出入境检验检疫协会主办的两岸农产品食品质量安全研讨会上，来自两岸的专家、学者、企业界代表，就两岸贸易中食品农产品的检验检疫法律、法规及相关要求展开交流与讨论，探索确立两岸民间及行业协会常态化对接交流模式及沟通渠道，并由福建省检验检疫协会与台湾两岸安全水产委员会共同签署《闽台水产品质量安全信息交流备忘录》。赴马祖与相关查验部门沟通、探讨黄岐与马祖对台小额贸易更为便捷的措施，赴台参加第二届两岸农产品检验检疫研讨会，并代表大陆植检专家组作大会交流。
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